古老血統比對的小紀錄

 

跟加州的一位DNA match到的小妹妹聊天，聊到女性的粒線體可以追溯到幾萬年前，她傳了安海祐希跟一個藏人是超遠房姊妹（三萬年前同一個女祖先）的影片給我看。

跟安海祐希當姊妹感覺很厲害，三萬年前同一個祖先這個說法也很厲害。

GEDMatch上提供了一些從考古研究所獲得的古人DNA，我一時興起就拿了自己的DNA去跟古老基因比對(ancient DNA Comparison)。因為想要做更進一步的常染色體一對一比對(Autosomal One-to-one Comparison)，我把恕限值設定在3.0 cM。比對結果我有三個大於3.0 cM的Archaic Matches，分別是：

進一步使用網站上的常染色體一對一比對：

45,000年前西伯利亞Ust'-Ishim人的基因聽起來很威風，12,500年前北美印地安人的基因聽起來很神祕（跨海了耶是不是有點遠），於是無聊的我又把親人們的DNA也拿去比對一下。

跟Ust'-Ishim < F999935>的比對

老爸

茜

阿姨

老弟沒有match到，我跟我爸、我阿姨三個人match到的DNA片段通通不一樣也是很神秘的一件事。阿姨是四人中跟Ust'-Ishim人match的DNA最長、重合也最多的。

跟Clovis-Anzick-1< F999919> 的比對

 這次全部的人都有比對到，阿姨依然是四人中跟Clovis-Anzick-1 這個小男嬰match的DNA最長、重合也最多的。然後我、我弟還有阿姨結果都有Chr9那一段耶~ （後來想想這不是正常的嗎？因為我們的粒線體都來自我外婆，前一個對不起來比較奇妙） 

老爸

茜

老弟

阿姨

＝＝＝＝這一小段是跳到楊先生的比對＝＝＝＝

無聊的我，決定幫楊先生也來做一下比對。用3 cM只比對出Ust'-Ishim< F999935>，調整成2 cM也一樣，真不好玩（咦？）

• Largest segment = 4.1 cM
• Total Half-Match segments (HIR) 7.1cM
• 2 shared segments found for this comparison.
• 213608 SNPs used for this comparison.
• 48.099 Percent of SNPs are full identical.

＝＝＝＝楊先生比對結束＝＝＝＝ 

親人中跟古老基因match最多的是我的阿姨，有F999916、F999919、F999935、F999937、F999957。

各自做了一對一比對之後整理如下

我在網路上查了Mt-DNA的相關資料，看到一個［粒線體夏娃］（mt-MCRA）(MCRA= Most Recent Common Ancestor)的說法，用阿姨比對到的三個Mt-DNA來看，有R、D4h3a、A2f2三個分支，這三個分支向上追溯、匯合在L3的位置。

L3分支是5~7萬年前人類從非洲向外遷徙時所攜帶的粒線體，源自東非，擴展到西亞，然後是南亞跟東南亞。L3底下的M分支代表的是遷移往亞洲、地中海盆地、遷回非洲（D是其中的分支）；N分支遷移往歐亞大陸（A、R是其中的分支）。

然後看完了我還是一臉茫然，只知道幾萬年以前的祖先從北非開始移動，然而我要怎麼確定我跟安海祐希有沒有同一個36宗族母親，還是不知道要怎麼做 XD

基金短線交易整理。國內+境外

在網路上看到基金的[短線交易]規定，一定期限內交易會被收取短線交易費，決定研究一下以免不小心虧了。

不過網路上整理好的文件時間都有一點久了，最好的方法還是在出售前到集保基金觀測站確認。
境內基金網址：https://announce.fundclear.com.tw/MOPSonshoreFundWeb/M01.jsp

境外基金網址：https://announce.fundclear.com.tw/MOPSFundWeb/M01.jsp

［國內］ 14日以上安全

• 國內大多數為7個日曆日、買回費率0.01%。
• 例外（比較貴）：
• 景順投信系列，7日，0.5%
• 元大指數型基金，7日，0.5%
• 施羅德中國高收益債券基金，7日，1%
• 7日：日盛(0.02%)
• 7日、買回費率0.1%：瀚亞、德信、宏利
• 例外（比較便宜）：
• 宏利債券型基金短線交易定義為7個日曆日(含)，買回費率0.01%
• 14日：鋒裕匯理(0.02%)、路博邁(0.02%)、貝萊德(0.03%)、聯博(0.2%)、富蘭克林(0.2%)、富達(0.2%)、安聯(0.3%)、摩根(0.3%)、柏瑞(0.3%)、安本標準(0.3%)

［境外］除了駿利亨德森遠見以外，30日以上安全

• 7日：摩根、匯豐中華、德銀遠東、野村NN(L)、百達、法銀巴黎
• 14日：安聯、路博邁
• 21日：富盛
• 27日：景順
• 30日：聯博、施羅德、富達、野村天達環球、野村愛爾蘭、柏瑞
• 30日+10萬美金：駿利亨德森
• 90日：駿利亨德森遠見

使用MyHeritage DNA kit需要的時間整理

陸續有親朋好友購買MyHeritage的DNA分析產品，於是我畫表格紀錄的毛病又來了，可惜有些日期沒有記錄到。

目前正在等新的結果，陸續更新。

　　下單　　美國寄出　　寄達台灣　　從台灣寄出　　抵達美國　　結果產出

我　7/27 '23　　？　　　　8/09　　　　8/10　　　　　8/22　　　　9/1

煌　3/31 '24　　？　　　　？　　　　　5/06　　　　　5/22　　樣本有問題重寄

煌' 　　　　　　6/15　　　6/27　　　　7/01　　　　　7/12　　　　7/28

豪　　？　　　　？　　　　？　　　　　7/01　　　　 7/12　　　　7/31

雪　3/31 '24　　？　　　　？　　　　　5/24　　　　　6/12　　　　6/29

鵬　5/26 '24　　5/30　　　6/18　　　　7/12　　　　　7/25　　　　8/11

二　　　　　　　　　　　　　　　　　11/11　　　　 11/27　　　　12/13

滿　　　　　　　　　　　　　　　　　11/11　　　　 11/27　　　　12/13

從美國寄出到台灣理論上需要8-12個工作天，因為MyHeritage使用的是DHL的平信來寄送，2023年的時候寄送速度滿快的，但2024訂購的時候一直有狀況，打電話問DHL客服後告知平信時間是15個工作天才會抵達。

中間還有遇過管理員代收結果英文看錯所以包裹發錯人，然後對方收到一個禮拜了都還沒拆包所以發現 =.= 我看了好久的錄影帶才找到是誰收走了我的包裹，英文地址包裹真是命運多舛。

從去年到今年的時間來看，整個寄送時效好像變慢很多，不知道是不是因為國際海運壅塞了。

　　　下單～收到　　寄出～lab收到～結果產出　（單位：天）

我　　　　１３　　　　　　１２　　　　１０

煌　　　？／１２　　　　１６／１１　　１６　　

豪　　　　　？　　　　　　１１　　　　１９

雪　　　　　？　　　　　　１９　　　　１７

鵬　　　　２３　　　　　　１３　　　　１７

二　　　　　　　　　　　　１６　　　　１６

滿　　　　　　　　　　　　１６　　　　１６

多倫多大學的暑期英語營隊

 

這個暑假我幫楊川報名了多倫多大學的暑期英語營隊，營隊的成員來自世界各地，當然也有講中文的，所以如果有小孩說他去加拿大營隊通通講英文那一定是騙人的，畢竟還有來自兩岸三地的朋友。

出國前楊川對要去加拿大念三個星期的英文抱怨許多，結果出國後如魚得水，上課表現挺好的，還認識了很多新朋友。有趣的是被誤認為是日本人可能是一種家學淵源，楊川在加拿大認識最多的是日本朋友，至今仍以ig保持聯繫。這位大妞這個周末到台北同學家拜訪+慶生，十月要去東京找三個同學吃飯，明年三月也有日本同學要來台灣找他，我只能感嘆世界跟我小時候差別真大，我以前認識的外國朋友都因為懶得寫信而失去聯絡。

決定要讓楊川出國學英文時我有問過代辦的費用，但是被某家代辦的價格嚇到，問過加拿大的表哥Roger Chen後，本來要找兩位表哥所在的Calgary University的營隊，可惜該校暑期只有專業營隊，看起來是提供給大學交換學生專用。無聊的我找了加拿大排名第一的多倫多大學，沒想到有各種英語營，阿母我本人看上的是一個類似世界公民的、有主題的營隊，很可惜楊川的英檢成績不夠，只能參加General English Course…

2023年營隊的費用在下面這張圖，我給楊川報名了早上3週的General English Course加上下午3週的Intensive English Course，據說很多人都只參加上午的課程，下午就去參加社團活動。上午的課程有分班考試，同一個班級同學英文程度相近，下午因為參加的人少，班級程度差異較大。但不管在哪一班楊川都是一個大姊姊的存在，因為2023年的營隊只限18歲以下。

感覺營隊內容每年都有一些調整，因為2024年營隊（下面的圖片）只有3週的課程，分為6、7、8三個梯次，且下午的課程也分成三個主題，裡面居然還有全球商務這個主題。價格部份也稍微有一點提升，三週從4,850提高到5,050。更多內容請看這裡：https://internationalprograms.utoronto.ca/international-summer-programs/youth-iep/dates-fees/

 

於是，無聊的我想了解一下之前的費用，就上網找了一下庫存網頁，發現它的課程每年都在改變。

2020年，3~4週，3週只有上午的課程，有12-14, 15-18兩個年齡區段，分6、7、8月三個梯次。

2021年，只有3週&只有上午課程，年齡限制為14~17。分7、8兩個梯次。

2022年，2~3週，一般課程年齡限制為13~18，學術預備為15~18。另外還有全日課程，主題為TOEFL or IELTS，年齡限制15~18。分7、8兩個梯次。

2023年，3~4週，年齡限制15~18。分7、8兩個梯次。

2024年，只有3週，分6、7、8月三個梯次。

 

2021年只有半天的營隊應該是因為疫情的關係吧。

底下這個是2022年的營隊收費。

祖源or健康DNA檢測產品的整理

因為我廢話很多，所以結論寫在最前面吧。以下是金牛座茜的個人推薦。

• 只做祖源分析：推薦AncestryDNA（99 USD，資料庫最大）或MyHeritage（39　USD，現在大打折）。想要詳細的遷徙路線，推薦FamilyTree DNA。
• 想做祖源＋健康：推薦Nebula Deep（374 USD，含終身會員）(但是要等超久而且介面不太親民)
• 只做健康分析建議：推薦Selfdecode（199 USD，年費99）
• 想做完整基因測試：推薦Nebula Deep（374 USD，含終身會員）(但真心需求不大)

Katy Willis於7/25在DNA weekly發表了《10 Best DNA Test Kits in 2023》，我那天也在同一天整理了我找到的DNA測試資料。當時沒看到他這篇，但看到可能也沒有太大的幫助，因為在不同的國家，取得產品的難易程度差很多，比方許多人推薦的23&me就無法寄送到美國以外的國家。

Katy Willis主推AncestryDNA，理由是他有最大的DNA database，之後推薦了MyHeritage（便宜）、Living DNA（有大量健康篩檢）、FamilyTreeDNA（追蹤父系、母系）、Nebula Genomics（全基因檢測）。

另外五種比較像是健康的測試：SelfDecode（可上傳其它家的DNA報告獲得即時結果）、LetsGetChecked（針對性別的健康篩檢）、My Toolbox Geonomics（控制飲食習慣）、Everlywell（過敏、壓力等健康篩檢）、InsideTracker（飲食、健康計畫建議）。

老實說當時我在整理資料時，很多資訊都是參閱AncestryDNA還有23&me的網站，因為他們的說明是最多的，可以了解DNA測試有哪些種類，以及測驗的概念。但AncestryDNA的區域列表沒看到台灣（更新後台灣仍然跟中國畫在一起，稱為中東亞），讓我以為23&me的資料比較多，看了Willis的文章才知道AncestryDNA是database最大的公司。進一步研究，它的亞洲劃分68區，歐洲有1501區，所以資料庫應該是以歐洲為主的。

我把文章中提到的內容跟我之前整理的合併，黃底是文章中的補充。

• Ancestry  https://www.ancestry.com/dna/
• MyHeritage　https://www.myheritage.com/dna/results/1623671288
• Genelife　https://www.genelife.jp/pages/all-products
• 23andME　https://www.23andme.com/dna-ancestry/

 

• Circle DNA https://circledna.com/tw/
• Living DNA https://livingdna.com/int/kit/wellbeing-kit
• FamilytreeDNA https://www.familytreedna.com/

本以為香港公司亞洲的區域會比較多，結果也沒有。 

該篇文章還提到了幾個產品，也有做祖源的分析，但主要是健康的分析，就不整理到表格了。

 

〈Nebula Genomics〉https://nebula.org/deep-genetic-ancestry/

哈佛大學教授創立的公司，目前正在五周年特價。檢測方案分為Standard (299USD)、Deep (649 USD)、Ultra Deep (2164 USD)。

這間公司主打全基因分析，這在台灣要好幾萬元，所以可以看到Ultra Deep的方案算起來也是要台幣6、7萬元。此外，他需要購買終身會員，價格是275 USD。所以如果只是想做祖源測試，這間的產品不划算，但如果要做一般的健康測試，Deep的方案目前特價374 USD（含會員），如果想要探討罕見疾病Ultra Deep的方案目前特價874 USD（含會員）。

補充：這公司祖源的部分與YFull公司合作。

 

[補充一下購買的經驗] 

2023/8/16購買，2023/9/17收到後採樣、註冊、寄回，2024/2/4結果終於出來了。網站上的報告非常多，但是祖源分析採用的是Eurogenes K36，這個其實用其他公司的結果也能上網分析，另外如果要分析y染色體部分還要支付45 USD。

個人認為對於自己的基因vs健康部分的研究比較有興趣的人比較適合這個產品，只是想看祖源的話買MyHeritage比較划算。

此外，雖然可以看出這個網站是一個很認真更新的網站，資料很豐富，但是沒有表格整理，我個人覺得像我這樣的普通人在閱讀上有些困難。

〈SelfDecode〉https://selfdecode.com/?nab=0

這間公司只有最完整的方案包含祖源分析，費用為299 USD，如果只是為了做祖源不划算，但如果是為了做遺傳變異分析、希望獲得健康資訊、希望獲得飲食、營養、生活方面的建議，他的費用是199 USD。甚至可以選擇花99 USD，上傳在23&me、AncestryDNA、FamilyTreeDNA、Courtagen、MyHeritage…等公司做的原始 DNA 數據，來獲得客製化的健康計劃。

這個網站提供的健康計劃的界面看起來很清楚，是一目了然的呈現。

〈LetsGetChecked〉

比較像是健康檢查，除了採口腔細胞，還需要採集血液、尿液、糞便…等，用來評估個人健康狀況。我覺得台灣就可以做了。

〈My Toolbox Geonomics〉https://www.mytoolboxgenomics.com/

透過基因分析提供客製化的飲食計畫，同時分析食物耐受度、過敏源。

感覺跟Genelife 的sport很類似，但完全沒有祖源部分。

免費運送範圍為加拿大、美國。

〈Everlywell〉https://www.everlywell.com/

針對睡眠、壓力、荷爾蒙、心臟健康、生育能力和過敏的測試。這間感覺比較像是健康檢查的公司，台灣應該就可以做了不用跨國去做。

96種食物過敏測試199 USD

204種食物過敏測試299 USD

〈InsideTracker〉https://store.insidetracker.com/

提供改善健康的建議以及營養補充的建議。價格為699USD起。

 

祖源部份我自己最想買的是日本Genelife Haplo3.0，因為它亞洲的樣本數比較多，檢測Y-DNA、mtDNA，但他無法寄到台灣，只能放棄，而在能寄到台灣的樣品中：

只想做祖源的話推薦AncestryDNA，因為它的資料庫最大 (價格99 USD，檢測autosomal DNA，另外還要支付國際運費)，而且FamilyTreeDNA、MyHeritage都可以匯入在AncestryDNA分析的raw data進行匹配。其次是MyHeritage，雖然它的資料庫不夠大，且以歐洲為主，但它現在大打折，一盒39 USD，一次購買兩盒免國際運費。

另外，如果想要了解父系、母系的遷徙路線，那推薦FamilyTree的產品，目前看起來它的mtDNA資料庫是最大的，Nebula網站上也提到這家的粒線體資料庫最完整，看起來祖源分析部分也跟這家合作，目前FamilyTree粒線體分析特價129 USD。另外它的Y-DNA分析有三種，目前特價從99~399 USD不等。

可匯入其他公司資料的整理

如果同時考慮健康，健康檢測對我來說應該要包含[藥物風險]、[遺傳健康風險]，如果能提供一些過敏反應、飲食或是運動的建議那就更好了，綜合這些想法，健康+祖先我比較推薦Nebula Genomics的deep專案，目前特價374 USD，含終身會員。

• 23&me: 229 USD （年費69）（檢測autosomal DNA）
• Selfdecode : 279 USD（年費99）（檢測mtDNA）
• CircleDNA: 440 USD（含終身會員）
• Nebula Deep: 374 USD （含終身會員）（檢測Y-DNA、mtDNA）
• GeneLife Genesis2.0 Plus: 14900 JPD （檢測Y-DNA、mtDNA）

 如果只想做健康方面的分析及建議，我會推薦Selfdecode : 199 USD（年費99）

• Selfdecode : 199 USD（年費99）（檢測mtDNA）
• CircleDNA: 440 USD（含終身會員）
• Nebula Deep: 374 USD （含終身會員）（檢測Y-DNA、mtDNA）
• GeneLife Genesis2.0 Plus: 14900 JPD （檢測Y-DNA、mtDNA）

只想做完整的基因分析，我覺得可以考慮Nebula Genomics的deep專案，目前特價374 USD，含終身會員。

• Nebula Genomics deep: 374 USD（含終身會員）（檢測Y-DNA、mtDNA）
• Nebula Genomics Ultra deep: 874 USD（含終身會員）（檢測Y-DNA、mtDNA）
• CircleDNA: 440 USD（含終身會員）
• GeneLife WGS: 149900 JPD （檢測Y-DNA、mtDNA）（檢測Y-DNA、mtDNA）

其實CircleDNA買三組以上的話一組價格只需要315 USD，另外如果在網路上找到推薦碼還可以打6折。我就給他跑去申請一組，輸入sot520可能可以打6折=264 USD，算起來它其實比Nebula Deep便宜。但是考量完整分析程度，還是Nebula比較高，即使Deep都比Circle高。

可匯入其他公司資料的整理（健康分析）

葉黃素筆記

學妹說他吃葉黃素很有感，我平常亂買一通，吃那麼久好像沒啥特別感覺，決定研究一下該怎麼吃比較好，然後把吃過的葉黃素研究一下。

• 一天不要超過30mg(台灣)，美國建議不要超過20mg。
• 酯化型葉黃素穩定，但要酵素分解後才能吸收，游離型不穩定但可直接吸收
• 葉黃素:玉米黃素=5:1
• 搭配油脂效果更好
• 要有花青素、蝦紅素
• 食物裡的葉黃素其實就很多，生紅蘿蔔含量max。
• 富含葉黃素的食物：蛋黃、菠菜、羽衣甘藍、地瓜葉、芥藍菜、Ａ菜、胡蘿蔔、南瓜、甜椒、玉米、奇異果。

看來三多的好像比較好？年紀越來越大了，3c產品使用得又很多，我下次還是不能隨便買，還是應該要看一下成份。

BTW，台灣的產品似乎不習慣在網路上放仿單或是成份表，這樣要比較商品其實很不方便。

順手整理的健康DNA測試

先前有參加臺灣精準醫療計畫，最後的結果很簡略，就是一個表格，讓你知道可能對什麼藥物有過敏的可能。不過，有這樣的資料也挺好，需要使用到這些藥物的時候可以提供給醫生，減少過敏的機會。

其實我對祖源DNA測試比較有興趣，但找資料時發現其實這樣的測試多數好像是應用在健康，甚是於美容跟減重，DHC甚是還有應用在頭髮保養的，這應該是很多男士會想做的測試吧。

表格是針對健康測試的整理。

 

	1	2	3	4	5	6
	Circle Premium	Circle Health	Genelife Genesis2.0+	Genelife　WGS	myhealth	23andMe Premium
費用	629 USD 特價440	449 USD	14,900 JPD 特價11920	149,990 JPD	32,780 JPD	298 USD 特價229
項目	20類550項 飲食/運動/祖源/特徵/疾病/藥物	115項 癌症/疾病風險	360項 體質/疾病/能力/祖源	6,500項	300項	180項 健康風險/藥物/疾病/祖源
樣本	唾液	唾液	唾液	唾液	唾液	唾液
	全球免運費 FedEx運送 寄回香港	全球免運費 FedEx運送 寄回香港	不能寄到國外	不能寄到國外 目前缺貨		不能寄到國外

1. https://circledna.com/tw/premium

2. https://circledna.com/tw/health

3. https://www.genelife.jp/products/genesis2plus

4. https://www.genelife.jp/products/wgs

5. https://myhealth.euglena.jp/products/gene_analysis/

6. https://www.23andme.com/membership/