2024年10月26日 星期六

古老血統比對的小紀錄

 

跟加州的一位DNA match到的小妹妹聊天,聊到女性的粒線體可以追溯到幾萬年前,她傳了安海祐希跟一個藏人是超遠房姊妹三萬年前同一個女祖先的影片給我看。

跟安海祐希當姊妹感覺很厲害,三萬年前同一個祖先這個說法也很厲害。

GEDMatch上提供了一些從考古研究所獲得的古人DNA,我一時興起就拿了自己的DNA去跟古老基因比對(ancient DNA Comparison)。因為想要做更進一步的常染色體一對一比對(Autosomal One-to-one Comparison),我把恕限值設定在3.0 cM。比對結果我有三個大於3.0 cMArchaic Matches,分別是:

進一步使用網站上的常染色體一對一比對:


45,000年前西伯利亞Ust'-Ishim人的基因聽起來很威風,12,500年前北美印地安人的基因聽起來很神祕(跨海了耶是不是有點遠),於是無聊的我又把親人們的DNA也拿去比對一下。

Ust'-Ishim < F999935>的比對

老爸



阿姨

老弟沒有match到,我跟我爸、我阿姨三個人match到的DNA片段通通不一樣也是很神秘的一件事。阿姨是四人中跟Ust'-IshimmatchDNA最長、重合也最多的。



Clovis-Anzick-1< F999919> 的比對

 這次全部的人都有比對到,阿姨依然是四人中跟Clovis-Anzick-1 這個小男嬰matchDNA最長、重合也最多的。然後我、我弟還有阿姨結果都有Chr9那一段耶(後來想想這不是正常的嗎?因為我們的粒線體都來自我外婆,前一個對不起來比較奇妙) 

老爸



老弟


阿姨




====這一小段是跳到楊先生的比對====

無聊的我,決定幫楊先生也來做一下比對。用3 cM只比對出Ust'-Ishim< F999935>,調整成2 cM也一樣,真不好玩(咦?)

  • Largest segment = 4.1 cM
  • Total Half-Match segments (HIR) 7.1cM
  • 2 shared segments found for this comparison.
  • 213608 SNPs used for this comparison.
  • 48.099 Percent of SNPs are full identical.

====楊先生比對結束==== 


親人中跟古老基因match最多的是我的阿姨,有F999916F999919F999935F999937F999957



各自做了一對一比對之後整理如下


我在網路上查了Mt-DNA的相關資料,看到一個[粒線體夏娃](mt-MCRA(MCRA= Most Recent Common Ancestor)的說法,用阿姨比對到的三個Mt-DNA來看,有RD4h3aA2f2三個分支,這三個分支向上追溯、匯合在L3的位置。

L3分支是5~7萬年前人類從非洲向外遷徙時所攜帶的粒線體,源自東非,擴展到西亞,然後是南亞跟東南亞。L3底下的M分支代表的是遷移往亞洲、地中海盆地、遷回非洲(D是其中的分支);N分支遷移往歐亞大陸(AR是其中的分支)。

然後看完了我還是一臉茫然,只知道幾萬年以前的祖先從北非開始移動,然而我要怎麼確定我跟安海祐希有沒有同一個36宗族母親,還是不知道要怎麼做 XD

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古老血統比對的小紀錄

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